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5 WGCNA分析中，灰色模块基因数若过多是说明划分模块有问题么？

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5 我在用完hmm搜索后提取序列提不出来，请问一下是怎么回事

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5 在做无参考基因组的基因家族分析时，我能否用hmm方法用pfam号筛选全长转录组的di19家族成员

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snp-index算法具体是怎么算的

  • 2019-08-02 12:21
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5 抱歉打扰，我在做circos时遇到了下面问题，看到了您也遇到相似问题，想知道您是如何解决的，期待您的回复。

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用circos进行基因组共线性分析。config1.txt 用的是老师给的参考资料中的文件。最后运行绘图命令时出现如下报错，请问老师这个是哪里出问题了呀？要怎么解决呢？谢谢老师~

1 解决

5 R下载GEO数据没有显示GSM1625995 = col_double()

1 解决

5 GEO数据集expression matrix表达量很低，很多是负数，单通道芯片

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关于qRT-PCR的两个疑问

  • 2019-07-31 12:02
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5 你好 我现在在用cytoscape的conet做共现网络分析图，去掉世系之后确实是可以运行正常的，但是我做的图是需要世系的，因为需要标出图例，表明是在门分类下 具体是哪种微生物，请问我要怎么去调整taxonomy的数据格式才能使得conet不报错

  • 2019-07-31 11:12
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在鉴定长链非编码RNA分析中，合并转录本之后，如何批量从gffcmp.combine.gtf文件中提取class_code为i, u,和x的转录本?谢谢

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WGCNA 模块特征热图意义

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代码使用不清楚

1 解决

R语言中Venn图绘制，安装vennerable包时出现以下问题，寻求老师帮忙，谢谢老师。

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5 请老师帮忙看看为啥一样的操作，将anchors.simple更新了基因家族的数据进去就做不出来图了，不添加基因家族信息可以作图，而且名字改了 对应的mcsacn.layout 也改了

  • FIFA 2019-07-29 18:45
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5 老师，我按照您的方式把序列路径也填上了，可还是没读进去，帮忙再看看，谢谢

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5 通过转录组筛选出的基因如何设计定量pcr的引物，谢谢！

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5 eclipse当中R插件StatET安装遇到的问题

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5 构建进化树

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补充细节： 运行WGCNA代码后，12_Network heatmap plot_all gene.pdf 这个文件总显示文件大小为0