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基因家族分析

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不同物种共线性分析结果只有一对同源基因被发现，怎么检查是不是中间有出错，没有找到其他的基因

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老师，python 版本的MCScanX分析物种之间分共线性时查文献没有对照物种别人鉴定的基因，要自己先去鉴定吗

  • 2022-03-14 16:05
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请问现在应该去哪里下载MCScan呢？chibba.pgml.uga.edu上找不到mcscan了

  • eika 2022-03-13 22:35
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老师你好，mapchart添加标尺的时候总是出现下面的情况，标尺附近有黑条纹，另外我要怎么调整标尺的刻度大小

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老师您好！我要进行小麦基因蛋白互作网络分析，使用小麦与拟南芥找到8对同源基因，后来用Cytoscape进行美化时，要用所找到拟南芥映射小麦，这个映射用VLOOKUP比对时是用的之前找到的8对同源基因即下载的ortho-orthologs文件吗？

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老师您好，我要进行基因蛋白互作网络分析，用小麦与拟南芥找到8对同源基因，后来用Cytoscape进行美化时，要用所找到拟南芥映射小麦，这个映射用VLOOKUP比对是用的之前找到的8对同源基因即下载的ortho-orthologs文件吗？

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如何挑选所需的顺式作用元件？

  • Mask 2022-03-10 21:40
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只有基因组草图没有染色体级别的基因组可以做基因家族分析吗？？？？

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GEO2R三组之间怎么比较呢?

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在利用GAPIT做GWAS分析的时候，到第二步可视化绘图的时候出error

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利用tassel生成曼哈顿图的时候出error

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5 docker中的omicsclass/r-server镜像使用问题：无法与服务器的文件夹对应，因此上传不了文件

  • 2022-03-07 21:32
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老师好，我的docker镜像下载后，不能运行，应该怎么办？

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5 老师好！我分别用课程里fst, pi, TajimaD 方法筛选出的top5%基因，都是只有第一条染色体上的（我的数据一共有16条染色体），出的图也都只是第一条染色体的。但是用fst和pi联合筛选的基因，16条染色体上的都有。为什么会出现这种情况呢？

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哭(´;︵;`)，虚拟机下Linux全屏，不知道怎么回去了，情趣帮忙

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请问第一次结构域搜索时检出了八条结构域1第二次结构域搜索需要每个结构域都提取吗

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5 tassel做PCA分析时候的报错

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老师您好，我想问一下小麦扫描的90K芯片数据进行GWAS分析，在GWAS分析之前，可以跟着你们重测序和群体结构分析的课程进行吗？要是可以的话，重测序所需要的fastq格式的怎么弄，我现在只有基因型的格式（txt）

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老师，您好。想问一下，我做的基因家族有好几个pfam文件，hmmer搜索后，除去各个文件的重复转录本，最后合并成一个文档。但这个文档还是有重复的转录本，是什么原因造成的呢？