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在初次docker运行程序时发现问题

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3 MCScanX分析时 transcript_id与基因组蛋白序列ID不一致，不能获得对应的.pep文件

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做基因家族分析时，用MCScan做共线性分析，跟着教程走没有发现有串联重复的基因，这种结果正常吗？

  • 2023-05-24 13:51
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用MCScan做共线性分析时，准备allmRNAID.txt文件，发现有些转录本定位在了contig上，这些定位在contig上的转录本需要算进去吗？

  • 2023-05-24 00:55
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做基因家族分析中的染色体定位图，发现有基因定位在contig上，怎么办？

  • 2023-05-23 13:02
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很久不用docker 后，再次打开docker时提示docker failed to initialize Docker Desktop is shutting down怎么办呢？删除 AppData\Roaming\Docker\settings.json也不能解决问题

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老师，您好！我在做顺式元件分析和共线性分析时，总是基因组文件ID名报错，应该如何修改呢？还请老师指点，谢谢老师

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10 MCScanX 共线性区域太少

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老师你好，我在使用qiime进行聚类分析中的pick_open_reference_otus.py进行聚类时，总是提示usearch61的版本不对，后来使用psortmerna_sumaclust 分析到一半的时候也开始报错了

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5 小白刚开始学，请问这是为什么，做了好几天了还是不知道怎么做，恳求指导谢谢

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下载了XQuartz之后，安装的bioedit还是打不开

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gene-family镜像中paircoil2报错

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10 使用ALLHIC流程只挂载出了一条染色体

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10 按着课程做，用的也是组学的数据，KEGG富集分析，只生成normal_vs_tumor_degene.id.map.tsv文件

1 解决

做MCScanX共线性分析时提取不了蛋白序列文件

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请问导入数据时总是出现：“no such command”是什么原因啊

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paircoil2使用报错

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有log2FoldChange的值怎么画热图

  • 2023-05-13 11:45
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老师您好，我在注释基因组重复序列时，使用repeatmasker、repeatmodeler、repeatproteinmas、trf注释完后，使用代码整合时出现重复序列比例大于100%，代码没有什么问题，请问还可能是什么原因导致的呢？

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老师您好，请问我在基因组重复序列注释，使用了repeatmasker、repeatmodeler、repeatproteinmas、TRF注释，然后使用代码整合到一起时，出现重复序列比例大于100%，代码没有问题，请问可能是什么原因导致的呢？