0 回答

群体结构分析时，执行代码报错

1 回答

老师好，请问一下为什么annovar注释完下图所示第1列与最后两列的突变信息不一致啊，网上很多教程我看也有这个问题似乎，所以比如第一行核苷酸到底是什么突变成什么了呢？谢谢！

1 回答

单倍型结果的解读

1 回答

为什么docker中cocker search 搜不到omicsclass了

1 解决

老师，您好，请问如何展示出染色体上某个基因的，或者说某个位点附近的核苷酸多样性值，FST值或者tajimas值。

0 回答

老师，请教一下，重测序时对bam文件排序出现问题，提示Exception in thread "main" java.lang.RuntimeException: Invalid lookback distance found.怎么解决呀

1 回答

电脑上无法学习

  • per 2024-07-27 11:16
1 回答

PSMC

1 回答

用GATK call SNP时报错

1 回答

VCFtools计算fst, pi, ROD, tajimaD, xpclr计算xpclr，得到这些结果作图的时候，曼哈顿图有阈值线，怎么给平滑曲线加上阈值线？另外，平滑曲线的值是经过怎么转换？

  • 2024-07-14 12:04
1 回答

求助，怎么把vcf文件中的非变异位点去掉呀？

1 回答

50 单倍型报错

1 回答

单倍型分析报错

1 回答

在重测序中对某一个基因在不同群体中的突变频率图怎么作，有脚本可提供不？

1 解决

使用重测序的var_density.R脚本没有按照染色体正确排序，这个怎么解决？

1 回答

10 在singuarity使用gatk时调用不了HaplotypeCalle指令

  • 233 2024-07-03 14:57
0 回答

得到INDEL,在做注释的时候报错。

2 回答

老师您好，我按照课程提供的流程泡自己的数据，在fst pi tajimaD分析的过程中，发现生成的曼哈顿图没有数据，在第一步的过程中，我们确实成功的生成了染色体对应的起始位置和pi值，但在pi多样性绘图输出时却发现没有数据，这是怎么回事呢，请老师帮忙解决

  • per 2024-06-21 16:37
2 回答

小麦GATK索引问题：对多个g.vcf.gz文件合并，遇到的问题？

2 回答

VCF注释

  • Jay 2024-05-16 11:41