SRA数据下载

我用命令ascp -v -QT -l 400m -P33001 -k1 -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh --mode recv --host fasp.sra.ebi.ac.uk --user era-fasp --file-list fastq.txt ./ 下载SRA数据时总是断开，有什么办法可以让这个命令重复运行，能不能帮我写个shell 脚本让这个命令一直运行。谢谢。

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分类：重测序

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omicsgene - 生物信息 2024-11-07 09:22

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

数据下载可以看看这个：https://www.omicsclass.com/article/964

https://www.omicsclass.com/article/2383

wget 加上-c参数支持续传；

随风 2024-11-07 10:26

下面这样的命令可以运行吗？

wget -c ascp -v -QT -l 400m -P33001 -k1 -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh --mode recv --host fasp.sra.ebi.ac.uk --user era-fasp --file-list fastq.txt ./

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