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Docker和比较基因组02.gene_family的orthofinder老是报错？？？

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二代DNA测序数据进行kmer分析，结果如下图，想请问可能的原因和建议。

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老师您好，我做比较基因组时，orthofinder2运行时出现报错，这是什么原因？该如何解决。请老师解答

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用GenomeScope软件预测基因组偏小

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为什么启动镜像时总是出现这样的报错啊老师

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nextpolish报错

  • _He. 2025-07-08 01:11
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ParaAT批量比对出现问题，这个是怎么回事？

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请问，基因完整序列位置是在gff注释文件中寻找吗？如下基因AUR62002649的基因位置在Chr03的44543929到44575315？相当于这个基因有31386个碱基长度？

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运行MCScanX查找共线性，java绘图出现错误为什么？

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Te amo老师 就是 我在做共线性分析哪里，遇到下面这个问题，就是遇到生成的*.axt文件是空的，然后报错我截屏在下面啦，您帮我看一下嘛 谢谢，上面的那个问题我已经解决啦。

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T2T基因组组装，去除自冗余，发现是minimap2 -D -cx asm5 -t 10 tmp1.fa tmp1.fa > tmp1.self.paf 命令产生的tmp1.self.pa文件中有各别行输出结果有问题（17[M::worker_pipeline::1636.730*6.86] mapped 12 sequences），后续awk命令报错。如下图

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我想问一下在进行WGD分析时，要算复制时间，基于物种进化速率的公式：The divergent time of the whole-genome triplication (WGT) event was calculated using the formula divergence dateKs / 2r.

  • jpq 2025-05-26 15:37
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三代HIFI数据的格式

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基因组组装BUSCO多拷贝过高

  • 2025-09-17 09:25
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Error correction and assembling warnings: * 0:12:28.935 6768M / 13G WARN General (kmer_coverage_model.cpp : 327) Valley value was estimated improperly, reset to 16

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老师，为什么我把data数据链接过来的时候链接不过来，会出现这样页面？

  • 2025-03-07 09:30
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老师，请问分析fasta格式的文件需要全部转成gff格式再分析吗？

  • 2025-02-26 23:00
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allhic进行染色体挂载，分组过程k=20，只分了一个组出了

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老师您好，在做比较基因组提取CDS、蛋白序列和最长转录本时候，提取出的文件是空的，这是什么原因，请老师解惑

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hic挂载时，选用那个内切酶