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docker pull omicsclass/genome-comparison:v1.0无法下载镜像如何解决

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老师您好，我做比较基因组时，orthofinder2运行时出现报错，这是什么原因？该如何解决。请老师解答

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共享性分析图片美化像这样字体盖住了该如何修改绘图的代码？

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用GenomeScope软件预测基因组偏小

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为什么启动镜像时总是出现这样的报错啊老师

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共线性分析获取基因对应的蛋白序列信息出问题

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基因组使用ont.fasta数据补gap时报错

  • _He. 2025-06-30 18:25
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T2T基因组组装，去除自冗余，发现是minimap2 -D -cx asm5 -t 10 tmp1.fa tmp1.fa > tmp1.self.paf 命令产生的tmp1.self.pa文件中有各别行输出结果有问题（17[M::worker_pipeline::1636.730*6.86] mapped 12 sequences），后续awk命令报错。如下图

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ParaAT批量比对出现问题，这个是怎么回事？

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请问，基因完整序列位置是在gff注释文件中寻找吗？如下基因AUR62002649的基因位置在Chr03的44543929到44575315？相当于这个基因有31386个碱基长度？

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运行MCScanX查找共线性，java绘图出现错误为什么？

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nextpolish报错

  • _He. 2025-07-08 01:11
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我想问一下在进行WGD分析时，要算复制时间，基于物种进化速率的公式：The divergent time of the whole-genome triplication (WGT) event was calculated using the formula divergence dateKs / 2r.

  • jpq 2025-05-26 15:37
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Te amo老师 就是 我在做共线性分析哪里，遇到下面这个问题，就是遇到生成的*.axt文件是空的，然后报错我截屏在下面啦，您帮我看一下嘛 谢谢，上面的那个问题我已经解决啦。

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三代HIFI数据的格式

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allhic进行染色体挂载，分组过程k=20，只分了一个组出了

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老师您好，进行比较基因组分析时候，单拷贝直系同源群为0，后续的分析就出现了报错，这是什么原因，是我选择的基因组不合适还是其他原因。

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老师您好，我在运行OrthoFinder2时，出现下面报错，请老师解答

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我让生物公司测一个莱甲的基因组，挂载的时候他们挂载6条染色体，但是我核型检测是13对染色体，挂13个的hic热图效果不如挂6个的图好，这种情况怎么处理呢

  • Nier 2025-09-07 10:21
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客服说泛基因组分析中26Pan-genes.list对应泛基因集分析章节中的final.last.gene.pair.txt文件，但是两者之间有差异，像是缺了几列是怎么回事，如下面详述，请解答