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老师,拟时序基础初步分析时,运行以下代码时Rscript $scripts/cell_trajectory_monocle3.r --rds ../04.cell_type_ann_leaf/leaf.added.celltype.qs \ --use.seurat.umap --groupby mycelltype -o monocle3.1 --cpu 6,出现图中报错,是因为聚类分群的时候resolution值太低了吗
单细胞
monocle
拟时序分析
HHHHHH
2025-09-10 11:39
0
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有参转录组数据分析,样品和基因组比对效率只有零点几,这是为什么?
naliupeony
2025-08-07 21:02
0
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254
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转录组比对中,同源性很高的两个基因比对不正确
同源基因
比对定量
转录组分析
山枫
2025-09-01 14:27
1
回答
241
浏览
老师,在初步查看cluster分群信息时,能否使用--cols代码,实现对某个cluster的颜色进行改变,具体代码是什么
cluster
HHHHHH
2025-09-19 16:51
1
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236
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老师,图1是我用图2的代码实现的,现在我想仿照提取细胞亚类的方式,使用图3的代码单独提取TIP这个maker基因,不提取整个cluster3,这个代码可以实现吗,或者是否有其他代码可以使用
单细胞
HHHHHH
2025-09-24 18:48
1
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217
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运行完Cellranger之后,没看见pbmc-stim里面有out文件夹,然后我再次运行的时候,报错了
哈哈哈
2025-09-15 11:29
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