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5 mcscan_layout参数都是有关什么呢？求教

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老师，您好！我在进行基因家族的分析时，在利用.aln文件获得新的hmm文件后，利用新的hmm进行hmmsearch，得到的新的domain.txt中我的目的基因的E-value的值已经达到2.2，是不是可以说明我的目的基因不属于我现在分析的这个家族？

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请问老师我在MAFFT上构建进化树，结果是This is a Neighbour-joining tree without distance corrections。

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请问老师基因家族单纯的只做视频那一套+荧光定量，能发sci吗？不加转录组。3区的

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请问老师我下载了根，茎，叶，花，种子的转录组数据，怎么做成基因家族热图形式。

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请问老师，我做油菜的一个基因家族，共线性分析没有加倍的基因，发文章会有影响码？

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基因组间的共线性分析为什么要对共线性区域进行过滤？

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10 在运用Linux系统命令，KA/KS，计算重复串联基因时，出现的duplication_gene文件，有点问题

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运行二次搜索结构域命令的问题

  • 2020-02-14 17:48
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circos 这个图

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motif绘图时，tbtools图上显示的motif跟meme.txt文件的不一致

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python版本的MCScan出错，在画共线性图时

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5 想要用evolview美化进化树，可是newiek格式的进化树一直传不上去，这是为什么？哪位老师知道，求助！

  • 2020-02-07 17:14
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mcscanx分析 family_circle_plotter 绘图时生成的图片残缺

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共线性分析与kaks计算

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进化树分组与预期不符

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clustalw2多序列比对，序列输入不进去

  • 2020-01-09 14:35
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在提取1500bp序列做顺式作用元件检测时，使用tiquxulie.pl这个脚本，开始时显示out of memory，我把虚拟内存提高到了4G，显示zsh：killed,得到的结果还是空的，请问老师这个问题怎么解决呢？

  • dec. 2020-01-09 00:43
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请教！基因结构分析出现这样的问题如何解决？

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20 请教用gtf文件获取基因与mRNA的对应关系的问题