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多样性数据实操 OTU注释报错

检查这两个变量设置是否有问题:

回答于 2020-12-21 11:01

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Linux服务器上,运行提取结构域的脚本的时候,出现未安装Bio/Seq...

自己得服务器由于有些软件没有安装,你需要自己安装对应的软件才行;

回答于 2020-12-21 10:59

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您好,我使用rescript结合您发表的qiime2分类器建立sliva数据库...

没有其他方法,这个很耗内存,至少 准备50G以上吧

回答于 2020-12-18 20:09

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如何大批量将核苷酸序列转为蛋白序列

写个脚本批量翻译一下:https://www.omicsclass.com/article/1174

回答于 2020-12-16 10:33

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老师您好,有个基因家族鉴定分析的问题想咨询您

可变剪切 其实就是一个基因多个转录本的形式,一个基因有多个转录本就会有多个蛋白和cds序列; 这些基础的生物知识还是要了解的; 基因复制是两个完全不一样的两个基因; 你这个再查查资料吧; 看看基因是否有复制现象,如果没有,可能是基因组组装或者注释错误吧; 

回答于 2020-12-16 10:31

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基因与mRNA的对应关系(两个,一个mRNAid_to_geneid,一个geneid...

不一定需要相等,你打开文件查看一下数据哪些地方是否有异常?

回答于 2020-12-15 11:46

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老师,您好,转录组分析时,比对完reads,进行sam文件转换为ba文...

电脑内存不够,为了防止电脑死机,系统自动杀死了任务: 看看这个:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2020-12-15 11:45

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Linux服务器上,运行提取结构域的脚本的时候,出现未安装Bio/Seq...

没有root权限,找有root权限的人帮你安装一下就好 了;

回答于 2020-12-14 09:56

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利用perl脚本去除重复的hmmer搜索的转录本ID,玉米运行出来结果显...

蛋白ID和gff里面的mRNA的ID不统一吧,你检查一下GFF文件和hmmer的第一列ID

回答于 2020-12-11 10:02

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老师,我用perl script/select_redundant_mRNA.pl去除冗余,报错

输入的文件路径写错了,或者文件不存在,你检查一下输入文件路径是否写错;

回答于 2020-12-11 10:01