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4094 个回答

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基因与mRNA的对应关系(两个,一个mRNAid_to_geneid,一个geneid...

不一定需要相等,你打开文件查看一下数据哪些地方是否有异常?

回答于 2020-12-15 11:46

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老师,您好,转录组分析时,比对完reads,进行sam文件转换为ba文...

电脑内存不够,为了防止电脑死机,系统自动杀死了任务: 看看这个:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2020-12-15 11:45

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Linux服务器上,运行提取结构域的脚本的时候,出现未安装Bio/Seq...

没有root权限,找有root权限的人帮你安装一下就好 了;

回答于 2020-12-14 09:56

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利用perl脚本去除重复的hmmer搜索的转录本ID,玉米运行出来结果显...

蛋白ID和gff里面的mRNA的ID不统一吧,你检查一下GFF文件和hmmer的第一列ID

回答于 2020-12-11 10:02

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老师,我用perl script/select_redundant_mRNA.pl去除冗余,报错

输入的文件路径写错了,或者文件不存在,你检查一下输入文件路径是否写错;

回答于 2020-12-11 10:01

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老师,win8系统的电脑可以装虚拟机吗

vbox虚拟机吗?可以的;

回答于 2020-12-11 10:00

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Linux服务器上,运行提取结构域的脚本的时候,出现未安装Bio/Seq...

可以使用docker 中基因家族的镜像,里面软件都已经安装了的; 你只需要在自己的服务器中安装docker就可以; 视频课程:docker安装课程 docker pull omicsclass/gene-family:v1.0.1

回答于 2020-12-11 09:59

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怎么在linux服务器上安装bioperl,以及Bio:SeqID 模块,非root...

可以使用docker 中基因家族的镜像,里面软件都已经安装了的; 你只需要在自己的服务器中安装docker就可以; 视频课程:docker安装课程 docker pull omicsclass/gene-family:v1.0

回答于 2020-12-11 09:57

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老师这是什么情况?

电脑的内存不够吧,被系统自动杀死了;增加内存

回答于 2020-12-07 10:34

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在基因家族分析的时候对GFF文件中mRNA与gene ID对应关系的脚本进...

你的mRNA  缺少parent信息,也就是mRNA来自哪个gene? 你对照示例数据修改一些GFF文件:

回答于 2020-12-07 10:32