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老师，我在重新描述一下问题，mascanx方法和BLAST计算KAKS时筛选...
blast方法只能找到串联重复的基因，大片段复制的基因无法判断； 你看看定义概念，还有视频课程；https://www.omicsclass.com/article/730
回答于 2020-12-29 14:38
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老师，我在重新描述一下问题，mascanx方法和BLAST计算KAKS时筛选...
blast方法只能找到串联重复的基因，大片段复制的基因无法判断； 你看看定义概念，还有视频课程；https://www.omicsclass.com/article/730
回答于 2020-12-29 14:38
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MCSCANX和KAKS计算出的共线性对数目不一致，虽然用的都是70%同源...
没有教过用kaks计算共线性，你弄错了吧； mcscanX和blast手动查找串联重复基因，方法不一样，有些差异也是正常；你写文章选择其一展示结果即可；
回答于 2020-12-28 13:17
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计算串联重复时，满足两个大于75的标准，但是不在一条染色体上，...
有可能是反转录转座：https://www.omicsclass.com/article/494
回答于 2020-12-27 08:13
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共线性绘图报错。看了别人的帖子解决不了
基因组文件上下不能颠倒，顺序应该对应，不然染色体号对不上： 类似文件解决办法：染色体ID不一致：https://www.omicsclass.com/question/1361
回答于 2020-12-24 17:51
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请老师帮忙看看，在运行jcvi(mcscan-python)画图(karyotype)的时...
嗯，看看别人怎么解决的：https://www.omicsclass.com/question/2125
回答于 2020-12-24 17:14
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