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利用perl脚本去除重复的hmmer搜索的转录本ID,玉米运行出来结果显...
蛋白ID和gff里面的mRNA的ID不统一吧，你检查一下GFF文件和hmmer的第一列ID
回答于 2020-12-11 10:02
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老师，我用perl script/select_redundant_mRNA.pl去除冗余，报错
输入的文件路径写错了，或者文件不存在，你检查一下输入文件路径是否写错；
回答于 2020-12-11 10:01
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Linux服务器上，运行提取结构域的脚本的时候，出现未安装Bio/Seq...
可以使用docker 中基因家族的镜像，里面软件都已经安装了的； 你只需要在自己的服务器中安装docker就可以； 视频课程：docker安装课程 docker pull omicsclass/gene-family:v1.0.1
回答于 2020-12-11 09:59
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怎么在linux服务器上安装bioperl，以及Bio：SeqID 模块，非root...
可以使用docker 中基因家族的镜像，里面软件都已经安装了的； 你只需要在自己的服务器中安装docker就可以； 视频课程：docker安装课程 docker pull omicsclass/gene-family:v1.0
回答于 2020-12-11 09:57
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在基因家族分析的时候对GFF文件中mRNA与gene ID对应关系的脚本进...
你的mRNA 缺少parent信息，也就是mRNA来自哪个gene？ 你对照示例数据修改一些GFF文件：
回答于 2020-12-07 10:32
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非模式生物的富集分析
刚刚试了下这个网址可以打开的；http://guangchuangyu.github.io/cn/2017/07/clusterprofiler-maize/
回答于 2020-12-07 10:29