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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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4110 个回答

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老师,如果租用服务器,内存得选多大的?

先试试 200G内存吧,具体没有测试过棉花基因组需要的最大内存;

回答于 2020-11-09 15:23

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hmmsearch新建HMM模型之后再次搜索出现报错,请问老师什么原因

请使用我们课程提供的biolinux 里面安装的软件分析,一般不会出错;https://www.omicsclass.com/article/526 你这个可能是安装的hmmer版本不对,请安装:3.1b2  这个版本的hmmer试试;

回答于 2020-11-09 09:56

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为什么用plantcare预测顺式作用元件时,很多基因连基本启动子元...

可能是文件有问题吧,你看看这些基因上的哪个bed文件是否ID位置一致; GSDS网站:http://gsds.gao-lab.org/index.php

回答于 2020-11-09 09:49

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我用docker omicsclass/rnaseq 下载ncbi上转录组数据总是出现下...

下载数据,建议看看这个,使用其他方法试试; 网络的原因,不是系统软件的原因:https://www.omicsclass.com/article/964

回答于 2020-11-09 09:48

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老师,我做的物种是棉花,基因组约3.5G 利用组学大讲堂的方法建...

可以联系我们给建立一下索引,我们有超大型服务器;18510686562

回答于 2020-11-09 09:46

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老师您好,请问一下构建进化树的一些亚家族是依据什么把它们划分...

不同的家族划分方法不一样,你可以阅读该家族的相关文献,看看别人怎么划分的借鉴一下;

回答于 2020-11-04 10:10

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进化树构建出问题

建议删除一些差异大的区域,尽量用保守的序列构建进化树;

回答于 2020-11-04 10:08

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bio-linux 挂载共享文件夹时报错No such device

共享目录建立方法见:https://www.omicsclass.com/article/260 如果设置都没有问题可以看看这个:可能由于vbox更新了,可能不稳定,建议下载老版本的vbox:https://www.omicsclass.com/question/2201/answer/2423

回答于 2020-11-04 10:07

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微生物多样性分析的程序复制shell中不能运行

命令有换行,你把换行前面的空白都删除试试; windows的shell 对于换行的命令兼容性不好;课程中也有提到,你可以修改下不让命令换行再复制粘贴运行: 注意命令顶头不要有空白;

回答于 2020-11-04 10:04

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请问这个共线性分析报错如何解决?

输入文件都检查一下,看看是否有问题,或者输入文件截图贴一下我这才好分析是否有问题。

回答于 2020-11-04 09:57