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4110 个回答

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等位基因频率是什么,最小等位基因频率又是什么?

allele frequency(等位基因频率)的概念:用一个例子说明:假设在100个人里面,某条染色体上某个位点有一个SNP,这个SNP位点有三个allele: A, C, G。 通过全基因组测序的方法我们发现这100个人里面这个位点的碱基A出现100次,C出现80次,G出现20次(人是二倍体,因此这个SNP位点有200个)。所以我们可以计算这三个allele...

回答于 2020-11-19 17:54

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请问有无预测蛋白质与蛋白质互作或蛋白质与DNA互作的网站?

蛋白互作的网站看看这个STRING数据库:https://www.omicsclass.com/article/1126

回答于 2020-11-16 10:20

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老师您好,请问在构建进化树的时候,发现分组与拟南芥中的不同,...

看看多序列比对的序列结果,再调整调整

回答于 2020-11-16 10:16

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请问构建进化树时出现三个分支是怎么回事呢

没看出问题,正常的;

回答于 2020-11-14 10:14

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GFF文件不能获取基因与mRNA的对应关系文件

试试这个修改一下:先把gene 搜索替换成mRNA,再参考这里修改一下: 可以参考这里:https://www.omicsclass.com/article/816

回答于 2020-11-14 10:13

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求助mRNA ID 批量+1问题

可以自己写脚本修改, 或者看看这个修改方法:https://www.omicsclass.com/article/816

回答于 2020-11-12 17:56

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老师,在建立索引时整个基因组跑数据需要内存大,能不能把基因组...

建立索引必须整个基因组一起建立; 如果想分开,做太麻烦了,后续所有的文件分析都需要分开;相当于你要做26遍分析;

回答于 2020-11-12 10:40

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老师,在建立索引时,棉花整个基因组较大,对内存要求较高,棉花...

建立索引必须整个基因组一起建立; 如果想分开,做太麻烦了,后续所有的文件分析都需要分开;相当于你要做26遍分析;

回答于 2020-11-12 10:39

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老师,您好,按照教程,启动镜像后,要设置路径变量,按要求运行...

目录结构不一样,你要是更改了目录位置,工作目录workdir需要相应更改才可以; 如果想避免麻烦,目录结构和上课老师的目录结构保持一致;

回答于 2020-11-12 10:37

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同一物种不同基因组(已经组装好)之间可以call snp么

建议用野生型基因组作为参考基因组call SNP

回答于 2020-11-12 10:35