omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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老师您好，请问在用plantcare做植物启动子顺式作用元件预测的时...

根据自己写文章的思路决定取舍，

回答于 2020-12-07 10:31

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刚刚试了下这个网址可以打开的；http://guangchuangyu.github.io/cn/2017/07/clusterprofiler-maize/

回答于 2020-12-07 10:29

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GATK是自动从bam文件中识别样本ID的，你做bwa比对的时候注意设置 -R 选项设置样本名字： -R "@RG\tID:$sample\tLB:$sample\tSM:$sample\tPL:illumina\tPU:$sample"

回答于 2020-12-07 10:27

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这个你写perl或者python脚本解决吧；生物信息入门到精通必修基础课：linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精通

回答于 2020-12-04 16:59

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继续运行下一步，bam文件应该是samtools命令生成的，你再看看命令；

回答于 2020-12-04 16:58

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没有完整的基因组的蛋白文件，无法分析这个；

回答于 2020-12-04 16:57

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输入文件路径写错了吧，你检查一下路径；

回答于 2020-12-02 12:02

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你运行下试试，看文件名字看不出问题

回答于 2020-12-01 12:52

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可以使用的；有些命令的路径不用写绝对路径，直接就可以使用；比如：meme 直接运行就可以；

回答于 2020-11-30 10:00

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可以看看这个课程，里面有讲如何转换成fastq文件：https://ke.qq.com/course/2645693?tuin=10522876

回答于 2020-11-25 16:29