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使用monocle2进行轨迹分析报错

这是由于igraph 版本高,导致 monocle2 与igraph版本冲突报错,这个问题需要 更改 monocle2的源代码 才能适应高版本的igraph。可以使用 5版本的镜像:single-cell-v5.0.tar.gz monocle2。 并且已经更新绘制热图; 代码已经更新:https://bdtcd.xetlk.com/s/4i88K6

回答于 2025-11-06 13:28

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新上的空间转录组课程可以用于分析华大基因测的数据吗

可以的需要转换一下才行;

回答于 2025-11-06 11:21

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docker镜像加速和教程界面不一样,不设置镜像加速下载速度很慢,...

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回答于 2025-10-15 12:15

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docker 镜像求助

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回答于 2025-10-15 12:14

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要进行单倍型分析,但是镜像不是搭建在2.0版本了,docker pull下...

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回答于 2025-10-15 12:13

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VCF文件按照指定的染色体排序

后面要跟这个文件的路径:picard.jar

回答于 2025-10-13 13:20

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t2t基因组,转录组数据注释

二代转录组多个样本直接合并即可:https://www.omicsclass.com/question/6317 三代数据需要组装成完整的全长转录本 (full length) 序列到est.fa 文件里面:est=$datadir/est.fa  #该物种完整的est 基因表达序列 

回答于 2025-10-09 10:47

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基因家族只有2个基因,可以做共线性分析吗,想检测一下有无复制...

基因家族数量太少,可以多个物种放在一起分析:https://www.omicsclass.com/article/760

回答于 2025-10-09 09:55

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老师我这里练习之前上课的内容想复制粘贴整个目录,以及创建新的...

磁盘存储空间满了,删除一些不要的中间文件,节约存储;

回答于 2025-09-30 11:48

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你好老师,我05以后的脚本在rstudio server 突然打不开应该怎么...

重启一下Rstudio试试:https://www.omicsclass.com/article/2080

回答于 2025-09-28 18:56