omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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老师，我用perl script/select_redundant_mRNA.pl去除冗余，报错

输入的文件路径写错了，或者文件不存在，你检查一下输入文件路径是否写错；

回答于 2020-12-11 10:01

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vbox虚拟机吗？可以的；

回答于 2020-12-11 10:00

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可以使用docker 中基因家族的镜像，里面软件都已经安装了的；你只需要在自己的服务器中安装docker就可以；视频课程：docker安装课程 docker pull omicsclass/gene-family:v1.0.1

回答于 2020-12-11 09:59

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可以使用docker 中基因家族的镜像，里面软件都已经安装了的；你只需要在自己的服务器中安装docker就可以；视频课程：docker安装课程 docker pull omicsclass/gene-family:v1.0

回答于 2020-12-11 09:57

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电脑的内存不够吧，被系统自动杀死了；增加内存

回答于 2020-12-07 10:34

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你的mRNA 缺少parent信息，也就是mRNA来自哪个gene？你对照示例数据修改一些GFF文件：

回答于 2020-12-07 10:32

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根据自己写文章的思路决定取舍，

回答于 2020-12-07 10:31

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刚刚试了下这个网址可以打开的；http://guangchuangyu.github.io/cn/2017/07/clusterprofiler-maize/

回答于 2020-12-07 10:29

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GATK是自动从bam文件中识别样本ID的，你做bwa比对的时候注意设置 -R 选项设置样本名字： -R "@RG\tID:$sample\tLB:$sample\tSM:$sample\tPL:illumina\tPU:$sample"

回答于 2020-12-07 10:27

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这个你写perl或者python脚本解决吧；生物信息入门到精通必修基础课：linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精通

回答于 2020-12-04 16:59