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4086 个回答

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请问个人怎么才能下载到TCGA的组学,临床和WSI影像数据?

TCGA处理之后的组学数据和临床信息个人是可以直接下载的,但是影像数据可能需要申请才行; 1. 基因组数据 mRNA表达数据(RNA-Seq、microarray)miRNA表达数据DNA甲基化数据蛋白质表达数据(如RPPA)基因拷贝数变异(CNV)突变数据(Mutation calls,SNV等) 2. 临床数据 患者的基本信息(年龄、性别、种族等)肿瘤分期...

回答于 46分钟前

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cellranger count 报错:job failed in stage code怎么解决

你的任务系统杀死了,共享服务器会自动杀死占有cpu多的任务

回答于 4天前

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老师,cellranger count 报错:job failed in stage code怎么解...

你的任务系统杀死了,共享服务器会自动杀死占有cpu多的任务

回答于 4天前

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请问,基因完整序列位置是在gff注释文件中寻找吗?如下基因AUR62...

对的这是基因的长度,包含内含子和外显子;如果有UTR注释,可能还包含UTR

回答于 6天前

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老师 就是在做群体structure分析的时候,clean.vcf.gz文件是下面...

你的染色体ID是不是搞错了,每个染色体只有一个SNP;你到基因fa文件里面看看,检查一下; grep '>' genome.fa#或者gzzcat genome.fa.gz|grep '>' 

回答于 2025-06-23 14:50

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RNAseq有参转录组分析差异表达分析免疫亚型之间差异表达这一环节...

edgeR包版本更新了, 代码里面的decideTestsDGE  改成 decideTests 

回答于 2025-06-20 16:11

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run_pipeline.pl -Xmx5G -importGuess clean.sorted.vcf.gz \...

截图太少了,看不出问题,你检查你的输入文件是不是存在,格式是不是正确

回答于 2025-06-19 18:33

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三代HIFI数据的格式

都测序花钱了,公司有义务帮你转换的,

回答于 2025-06-17 17:28

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Te amo老师 就是 我在做共线性分析哪里,遇到下面这个问题,就是...

这里有提示信息,你应该看一下;提示 基因ID不在 序列里面,你检查输入文件之间的ID是否匹配:

回答于 2025-06-11 21:41

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docker pull omicsclass/genome-comparison:v1.0无法下载镜像如...

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回答于 2025-06-10 09:39