单细胞转录组-inferCNV拷贝数变异分析介绍
单细胞转录组镜像代码更新4.0
scanpy 中 ScTransform分析:
spaceranger
空间细胞共定位分析结果解读 MISTy分析
用AI写代码只批量链接GEO 10X数据:
inferCNV 测试
空间转录组数据挖掘流程记录-甲状腺癌(GSE250521)
拟南芥单细胞分析流程
空间转录组实操课程
《转录组代谢组个性化数据分析》课程上架
单细胞转录组文章
非模式物种10X空间转录组单细胞参考基因组构建
我们进行kegg富集分析之后,除了会得到差异基因和KO编号对应的KOlist信息,还会拿到kegg pathway map的信息,分为html和png的结果展示,大概是这样的结果: 一般来说我们最好检查一下,这里...
华大stereo-seq 添加上底片转换成10X格式方便scanpy和seurat读入分析
不同物种进行转录组分析的时候流程大致相同,但是当我们做的物种有一个庞大的基因组,那么流程中有一些参数需要进行修改: 1. Markdup和SplitNTrim的时候不要生成bai的索引,主要是 Markdup的...
SAW华大时空软件使用
HISAT和STAR比对软件比较
空间转录组动力学分析
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.08.18.456898v1.full