KEGG 通路基因列表;
我们进行kegg富集分析之后,除了会得到差异基因和KO编号对应的KOlist信息,还会拿到kegg pathway map的信息,分为html和png的结果展示,大概是这样的结果: 一般来说我们最好检查一下,这里...
修改单细胞转录组分组
不同物种进行转录组分析的时候流程大致相同,但是当我们做的物种有一个庞大的基因组,那么流程中有一些参数需要进行修改: 1. Markdup和SplitNTrim的时候不要生成bai的索引,主要是 Markdup的...
10X 单细胞原始数据下载
兰花发育中器官发生的时空图谱数据下载示例
不管是重测序或者是有参转录组,很重要的一环就是将测序数据比对到参考基因组上。一般来说,常用比对软件都可以正常运行结束,但是当碰到超大基因组的时候难免会碰到一些问题,这些问题有的时候...
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进行gsea分析的时候需要gmt文件,需要到官网进行下载。官网需要注册一下才可以进行下载。 官网网址:https://www.gsea-msigdb.org/gsea/index.jsp 直接进入http://www.gsea-msigdb.org/gsea/d...
人类免疫细胞marker基因
单细胞转录组数据挖掘流程记录-LUAD(GSE131907)
张泽民 生信文章
单细胞转录组数据挖掘流程记录-LUAD(GSE123902)
rocky9 手动安装新罗马字体
肺癌细胞类型marker基因
小鼠单细胞转录组方法