植物单细胞分析方法
植物单细胞转录组基因表达也可以空间可视化了
手动绘制dimplot
singleR细胞注释
boxplot绘图分面
Seurat 对象手动添加降维结果 UMAP PCA TSNE 等
Y. Zhuang, Y. Geng, X. Guo, et al.
华大 空间转录组与10X 公司比较
华大的空间转录组 手动标注的组织区域如何添加到数据中
空间转录组分析的终极目标-细胞分割
seurat 读入10X spaceranger 细胞分割的结果并显示
Song, Y., Miao, Z., Brazma, A. et al. Benchmarking strategies for cross-species integration of single-cell RNA sequencing data. Nat Commun 14, 6495 (2023). https://doi.org/10.1038/s41467-023-41855-w
拟南芥花药细胞类型标记基因
pySCENIC 与 SciPy 高版本兼容问题修复