10 TCGA生存分析cut off值疑问

TCGA COX教程里的cut off值是2500,

请问老师

1、这个值是怎么计算出来的?

2、文献里一般都用risk score中位值作为cut off进行高低风险分组,然后再通过ROC曲线确定最佳cut off再进行高低风险分组。教程里的这个cut off是否恰当?为什么不用risk score做cut off,发文章该怎么解释?

请先 登录 后评论

最佳答案 2018-09-25 16:52

1. 2500 : 这个是估计的中位生存期。 准确的数字应该是2888 。

2. ROC 曲线,我们采用的是risk score ,选择的时间是估计的中位生存期。你可以细看一下survivalROC 这个函数。

请先 登录 后评论

其它 0 个回答