bcftools - 组学大讲堂问答社区

bcftools

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bcftools创建vcf索引失败

bcftools创建vcf索引失败

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安生水发布于 2024-03-18 13:44

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使用bcftools文件提取vcf文件子集

1. 准备好要提取的染色体及位置信息文件id.list。文件示例如下： Chr1 11787600 11793521Chr1 30028805 30042382Chr1 54966087 54970283Chr1 57228272 ...

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rzx 发布于 2024-03-11 18:13

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多款软件进行vcf合并--gatk、vcftools、bcftools

链接：https://www.jianshu.com/p/116c8e4c93f4

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星莓发布于 2022-09-21 18:00

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bcftools call SNP

bcftools call SNP

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omicsgene 发布于 2021-09-22 18:16

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合并不同sample的vcf文件，通过bcftools

通过GATK calling出来的SNP如果使用UnifiedGenotype获得的SNP文件是分sample的，但是如果使用vcftools或者ANGSD则需要Vcf文件是multi-sample的，这里就需要我们将不同samples的文件进行合并，可...

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安生水发布于 2019-10-28 17:59