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文章 aspera上传数据的时候老是链接中断,一晚上的时间白白浪费了,怎么办?

...细上传视频见:《NCBI和GEO数据库上传课程》 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

问题 prodigal预测基因后会去除partial=00的contigs

prodigal预测基因后会去除partial=00的contigs.但是我想使用metagenemark预测基因其输出的核苷酸文件没有partial信息,那是否过滤partial=00的contigs不是必要的

文章 RunUMAP函数报错,

... "pca", dims = 1:30)执行降维分析的函数,umpa的时候报错 报错信息如下: Error in irlba::irlba(L, nv = n, nu = 0, maxit = iters) :   function 'as_cholmod_sparse' not provided by package 'Matrix' 如何解决?,主要是因为Matrix和irlba的依赖问题,可以通过重装一下...

文章 PubMed文献按影响因子排序

...; 百度网盘地址:http://pan.baidu.com/s/1kU9aST5 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

文章 STAMP使用(组间差异)

...到,方法:https://www.omicsclass.com/article/1330) (2)样本信息表 2.步骤     (1)打开软件:点击左上角 file --> load data     (2)输入文件1,2     (3)点击OK得到如下结果,粉色标记下选择图片类型,黄色标记下可更改图片...

问题 如何获取基因与mRNA的对应关系?

...erl script/mRNAid_to_geneid.pl 获取 基因与mRNA的对应关系:脚本信息如下(是否应该修改?) 获取的基因与mRNA的对应关系的mRNA2geneID.txt,是这样的,不对好像

文章 mcsan结果文件说明

...向(相同为正,反转为负) *.anchors 共线性区块内基因信息文件,如图: ### 之间为一个共线性区块,每行是区块内基因对应关系

文章 ggplot2几个主题类型

...图技能,我们推荐:R语言绘图基础(ggplot2) 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

文章 awk将多行序列变为一行(Fasta序列文件)

将多行序列变为一行|删除ID后的注释信息并将ID与seq分行>输出新文件 命令行: awk '/^>/&&NR>1{print "";}{ printf "%s",/^>/ ? $0" ":$0 }' cds.fa|sed 's/trans=[a-zA-Z0-9]*\-[A-Z]*//'|sed 's/length=[0-9]* /\n/'>cDNA.fa 原始序列文件: 结果序...

文章 mclust analysis.r 基于模型的聚类

...652352011ELAVL144.387679619843831.8729000784291 -m 输入样本的临床信息: barcodepatientTCGA_StudyTCGA-A3-3319-01A-02R-1325-07TCGA-A3-3319KIRCTCGA-A3-3323-01A-02R-1325-07TCGA-A3-3323KIRC --mclust 是否对样本进行聚类 第一次运行脚本不进行聚类,通过返回的BIC(...

问题 关于基因上游顺势作用原件的分析及绘图操作步骤

...种染色体基因组文件如下 所有染色体都有 且基因位置信息没有错误 所以我想请教一下到底是怎么回事呢?

问题 如何获取一个基因家族在拟南芥植物中的所有成员!!!

想法是获取拟南芥植物的所有成员序列,然后通过分析获取隐马可夫文件,然后通过该文件在新的物种中获取该物种的一些信息? 以及如何构建隐马可夫模型

文章 GOrilla-一个在线GO富集分析的网站

...网页中会有具体的解释,根据解释理解即可 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解...

问题 braker.pl运行中断

...k/biosoft/GeneMark-ES/latest/gmes_linux_64_4//gmes_petap.pl 。没有报错信息,在GeneMark-ET文件夹下的gmes.log有显示error,但是没提醒具体的问题。请问如何解决?是用的docker运行genomic-annotation这个镜像

文章 重测序群体遗传进化分析之—进化树构建

...异(SNP,indel,SV,CNV)的主要手段之一,有了这些变异信息,后续可以做很多分析工作,例如: 遗传群体可以进行遗传图谱构建、BSA分析等;大样本量自然群体,可以进行群体遗传进化分析等。今天,小编先给大家群体遗传进化...