....nih.gov:/blast/db/FASTA/nr.gz ./ sra数据库可以利用ascp ENA网站搜索下载： ENA主页ENA搜索SRR号，SRR9169172 命令： /share/work/biosoft/aspera/latest/cli/bin/ascp -QT -l 300m -P33001 -i ~/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR916/002/SR...
老师，我想请教一下，根据我们基因家族分析课程的结果，ORF (bp) ，domain starteend，Sub-cellular localization和No. of introns怎么找
...ID=LOC3C026830T1.cds2；……；ID=LOC3C026830T1.cds25；等等，我用搜索替换来修改，命令为： sed 's/.cds[0-9];/;/' 这里面只能把cds1到cds9去掉，而cds10以后的名称不能去掉， 请问应该怎么做？
...证docker的daemon。我没管它，回车，后面将电脑重启。 结果，小鲸鱼出现了。。但是提示连接不成功，被拒绝连接了。应该是虚拟机和我的电脑里的关联不上的意思吧。但不知道该如何解决这个问题。如下图： 虚拟机的设置...
...证中，在盐胁迫和冷胁迫条件下IAA基因的表达趋势。 结果 01. 割手密基因组中IAA基因的鉴定及分布 以水稻31个IAA基因蛋白全长序列为参考序列，通过blastP方法鉴定，在割手密(v20190103)基因组中鉴定出38个基因cluster。每个clust...
...基因家族的hmm文件 该基因qlen大概500多，然后我第一次hmm搜索只得到了35个片段，而其中又有很多是同一个基因的不同部分匹配到了 hmm模型的部分，都是很小的一分部，请问老师这样的话是否需要做构建该物种特异的hmm模型，如...
4月7日，特斯拉给员工的一封内部信显示，4月13日起，特斯拉将采取削减开销措施，所有线上办公和职位级别较为关键的员工都将根据薪资水平的不同进行降薪。其中，在美国地区，副总裁以上级别工资削减30%，总监以上级别...
... 想问下，这种情况下，我是否可以在ncbi的proetin数据库搜索该物种并下载所有属于该物种的蛋白质，输入orthofinder进行分析。
miRNA测序遇到两个问题： 1.mibase数据库小鼠的前提和成熟miRNA参考基因组怎么找？是直接查找下载里边的吗？搜小鼠的该怎么搜索 2.代码中-k 接头序列，如果是Illumina双端测序样本选择P5还是P7，或者是样本的R1R2分开测
...trap consensus tree，将其nwk文件上传到evolview等了很久也不出结果。而用Original Tree的nwk很快就出图了。 我尝试用MEGA7打开nwk文件，Original Tree的可以打开，bootstrap consensus tree的打不开 两个nwk文件大小不一样，Original Tree的9KB，boots...
...cape每月更新其相关的40多个数据库，以确保提供最准确的结果。因此Metascape数据库可以作为富集分析的比较好的手段。 metascape：https://metascape.org/gp/index.html#/main/step1 step1：粘贴基因列表或者是上传基因文件 step2：设置物种 St...
...列3. all_transcripts.fasta.clean # 2的序列进行seqclean过滤之后的结果4. FL_accs.txt # 全长转录本序列的ID名称5. tdn.accs # denovo 组装的ID（无参转录本预测的序列）6. SQLite 或者是mysql数据库7. alignAssembly.config # PASA运行的 二、PASA运行命...
请问老师如果我做TPS家族的基因家族分析，我的这个实验结果可以放到文章里面吗？ 我的实验得出了这个植物的一些基因的TPS功能表达。
...我们本地的数据上传到服务器上去运行，然后把运行后的结果下载下来，这个时候就要用法ftp链接软件Filezilla了,这里给大家介绍这个软件的安装与使用: 1.下载软件地址：https://filezilla-project.org/ 注意下载客户端软件，可安装在w...
..."包名: " , __PACKAGE__ , "$Foo::i\n"; 1; 执行以上程序，输出结果为: 包名: main 1包名:Foo10包名: main 100包名: main 10 BEGIN 和 END 模块 Perl语言提供了两个关键字：BEGIN，END。它们可以分别包含一组脚本，用于程序体运行前或者运行后的...