计算OTU间两两相关系数矩阵 ，数据量大时，可应用WGCNA中corAndPvalue, 但p值需要借助其他函数（the Benjamini and Hochberg false discovery rate (FDR)）矫正。具体如何实现呢，望大神赐教！！
...个基因名称才对？ 基因组注释文件gff3中一开始显示的数据如下图： 各种染色体编号之后，还有bd_数字1×数字2。。这是某编号染色体的补充数据吗？？实在有点懵。
...影响相关基因的表达促进肿瘤发生。在肿瘤单细胞转录组数据分析过程中，肿瘤细胞类型的注释可通过tumor related marker gene的表达情况(是否高表达)做出判断。而inferCNV可以从拷贝数变异的角度进一步验证肿瘤细胞类型的注释，或...
...势（图c）。 文章链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31900452/数据链接：https://github.com/ththi/European-Root-Suppl此外，我们在网易云课堂上有各种教学视频，有兴趣可以了解一下：1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-...
分析甲基化数据需要标准化吗？用什么方法
老师您好，请问在基于sqlite数据库运用pasa进行基因组注释时出现了以下问题，是什么原因呀，应该怎么解决呀
...前3天， 并且文章的作者是——韩国人，这篇文章的自杀数据也是基于韩国的全国性数据， 文章介绍里面这样写道： “自杀是全球最重大的公共卫生问题之一，2016年，全球年龄标化自杀率为每年每10万人中10.5例(10.5/10万)。而...
我用最新版的基因组数据进行序列相似性（blastp）和结构域分析，得到的基因家族个数只有别人文章里的一半。请问您觉得我是哪里出问题了？您有更准确的基因家族鉴定的方法嘛？
进行有参比对时，输入文件不为空，但是比对后的sam文件为空，这是啥原因。另外测序为单端测序，是否链式未知（公共数据库）。
数据事先整理好这样之后我利用这个代码运行，但是有个代码没看懂，就是log_rank_p那步，图中标红框的那个2代表的含义，
利用GSEA分析之后，出现的结果里面突然不明白，Table: GSEA details 里面应该是包含这个GO set的所以基因的意思，后面yes表示上传数据有这个基因 那个core enrichment含义是什么。。。。
请问除了在数据库里找到注释的方式外，还有其他方式能够找到TSS位点或什么实验能验证TSS位点不?
...视频教程，涵盖基因组分析、群体研究、转录调控、癌症数据库挖掘、微生物研究、生信基础（Linux、Python、R、Perl）等方向，学员数量已超过70000人！多门课程被推送到网易云课堂首页推荐位，并在网易官方的金云奖评选中荣获...
解析之前，已经按照课程要求准备了相应数据放置在文件夹内，然后运行wgd解析时候，出现未找到命令。这个是系统服务器未安装相应脚本或软件呢？？还是？？？
...用nextdenovo得到初步的基因组，随后结合ONT、HiFi、illumina数据对基因组进行了优化，获得polished组装，此时一共有8个contig，按照长度排列为1-8，其中Contig1-4的双端和Contig5的一端含有拟南芥的端粒重复元件。NT比对将contig8归为叶绿...