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老师，我想问一下，我在预测顺式作用元件时，在提取出来的基因上...
正常的，基因组中基因上游可能没有组装成功；所以截取到了带有N的序列； 你可以检查一下基因组是否是这样；
回答于 2018-12-17 15:27
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用ncbi搜索pfam号 为什么没有 出来的是pmid 怎么办 文章也没有pf...
如何查找Pfam号：https://www.omicsclass.com/question/268 如果还是查找没有，说明你研究的基因家族本身就没有pfam号；
回答于 2018-12-17 15:25
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对于标准化的数据应该如何绘制火山图呢？
火山图是做完差异分析之后才能绘制；与标准化数据无关； 绘制火山图见：https://www.omicsclass.com/article/191
回答于 2018-12-17 10:39
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老师，我在做共线性分析时，在准备配置文件时有一些关于染色体的...
pt 和mt 一般是叶绿体和线粒体，通常不做共线性分析； 如果要做的话，染色体名字是什么就填什么，不一定非要都是数字，0也可以；
回答于 2018-12-17 10:35
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MCScanX family_circle_plotter 运行错误
截图内容太少，无法分析原因； 只能给你建议： 检查输入文件路径是否写错，命令行是否写错，输入文件格式数据编写错误；
回答于 2018-12-17 10:33
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老师，我在两个基因组间的共线性分析时，在excel中用到vlookup时...
你得截图说明你的问题，不然我这里只能猜测： 1.你的公式写错；或者ID本身就没有查找到； 2.你往下翻翻，因为大部分是NA, 不是NA的少数，你可能没看到；
回答于 2018-12-17 10:29
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老师，在做共线性分析的时候，在gff文件中提取出来的基因位置信...
可以做的；提取不出基因对应的蛋白序列，我们这里会更新一节课程到基因家族分析中；解决不能提取的问题；
回答于 2018-12-14 11:31