omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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meme问题

请确认是导入的百度云盘上的biolinux，如果是的话肯定有这个meme软件的；https://www.omicsclass.com/article/526 linux系统不会使用推荐学习：生物信息入门到精通必修基础课：linux系统使用、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图

回答于 2019-04-03 13:27

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目前没有，会perl的话，可以用perl写一个小流程，批量进行计算；

回答于 2019-04-03 10:54

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只要有结构域，就是这个家族的基因。

回答于 2019-04-03 10:50

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我看你的GFF文件没问题，应该是可以提取出来的，你再试一下，或者把结果截图我看一下；

回答于 2019-04-03 08:56

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你用同一套参考基因组就行，不要用两个基因组。转录表达用二代数据做表达量就好了；

回答于 2019-04-03 08:55

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把这些物种基因组内的NBS基因的蛋白序列放在一起多序列比对，然后构建进化树就可以了；

回答于 2019-04-02 17:43

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如果是服务器一般开头：sftp:// 后面跟IP地址。再有检查IP地址和端口号是否写错；

回答于 2019-04-02 17:42

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要进行二次搜索，需要重新建立结构域hmm模型，建议选取可靠完整的结构域建立hmm模型。hmm搜索结果说明见：https://www.omicsclass.com/article/499 基因家族数量，建议看看相关文献；

回答于 2019-04-02 17:40

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在电脑的BIOS中把CPU的虚拟化打开一下参考：https://www.omicsclass.com/article/78

回答于 2019-04-01 21:28

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基因家族课程里面有这部分课程：学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读

回答于 2019-04-01 10:26