不同物种之间的共线性分析

在不同物种之间的共线性分析这一部分分析的最后一步,即运行命令

/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.graphics.karyotype  --format=pdf  --figsize=15x5 mcscan_seqid mcscan_layout(出图时)出错,错误如图片所示

attachments-2019-09-C4jVAXfK5d7dd3da90a88.png这是有可能哪里出错了?

在分析杨树和旱柳的共线性,分别有19条和38条染色体,前面的过程都和顺利,所需文件

attachments-2019-09-WCYuUqBf5d7dd4a2e5ec3.png以及SM.bed 都是对的,请问怎么解决?

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4 个回答

安生水
擅长:perl,基因家族,linux,chip-seq

你再仔细检查一下你的输入文件是不是正确

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omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS
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lotus

谢谢,问题解决了

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海阔天空

不同物种共线性分析时,出现以下报错信息怎么解决呢?no such file or directory  /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python

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  • lotus 提出于 2019-09-15 14:09