omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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第一张图是geo直接下载的矩阵文件，是经校准的log数值，而在按照...

你这个行名是芯片的探针ID，需要通过芯片的GPL信息转换成对应的基因ID，课程里面有讲的：GEO芯片数据挖掘、 GEO芯片数据不同平台标准化

回答于 2020-07-27 10:48

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这个文件已经是矩阵文件了，行名应该是探针ID，你需要把探针ID通过GPL信息转换成基因ID，GEO课程里面有讲的： GEO芯片数据挖掘、 GEO芯片数据不同平台标准化

回答于 2020-07-27 10:46

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最后得到基因的表达文件，列为样品，行为所有基因。可以对比一下课程中的输入文件；文件格式一致，代码都一样处理；

回答于 2020-07-27 10:44

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哪个符合你的要求就选那个就好了；

回答于 2020-07-27 10:42

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建议删除这个GAP

回答于 2020-07-27 10:42

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可以参考这里搭建一个本地GSDS网站，就不会打不开了：https://www.omicsclass.com/article/1308

回答于 2020-07-27 10:18

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回答于 2020-07-27 10:18

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回答于 2020-07-27 10:18

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可以参考这里搭建一个本地GSDS网站，就不会打不开了：https://www.omicsclass.com/article/1308

回答于 2020-07-27 10:16

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请使用我们组学大讲堂提供的biolinux的ova文件，里面安装了软件：https://www.omicsclass.com/article/526

回答于 2020-07-26 11:32