不同的家族特点不一样,筛选条件也会存在差异,这个筛选条件不是通用的;这个是筛选hsp20基因的; 分析自己的家族之前还是要多多了解自己家族的特点,自然就会了; 推荐课程:基因家族分析实操课程、
回答于 2020-07-23 12:59
mcscan是通过基因的位置判断染色体的长度的,哪些染色体上的基因看看是否在bed文件中有;
回答于 2020-07-23 12:56
你说得是我组学大讲堂里面转录组课程里面得问题吗:二代测序转录组数据自主分析 我们课程中没有用到这个命令。 你这个错误可能是基因组文件格式问题你再检查一下; 保证序列行每一行长度相等试试;
回答于 2020-07-21 18:17
基因组重测序得到的SNP更广泛更全面,只要测序深度足够高,理论上是可以发现所有的SNP信息的; 但是转录组分析就不一定,因为转录组测得是基因转录出来得mRNA,所以如果你测转录组那个基因不表达,你就测不到这个基因,你就无法知道这个基因上是否有SNP,再有,基因间区,或者内含子区得SNP也没有。 理解了转录组测序原理...
回答于 2020-07-21 13:38
vbox更新导致 你下载老版本的vbox重新导入试试:https://www.omicsclass.com/question/2556 我们慢慢不用vbox虚拟机,用更好的虚拟机docker:
回答于 2020-07-20 11:13