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基因家族分析:基因与mRNA的对应关系,出现如下错误

课程刚刚更新,你按照新课程脚本来分析吧; https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp 

回答于 2021-04-22 14:29

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在基因家族分析的时候,利用GFF文件中geneID与mRNA的对应关系的...

你看看你的GFF文件的这几行附近的:mRNA是否有parent 或者 ID 信息: 如果没有可能导致这个报错 再有我们基因家族课程刚刚更新了,包括一些脚本进行修改升级避免不必要的bug;你可以重新下载一下: https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp 

回答于 2021-04-22 14:25

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老师,我在做基因序列结构分析的时候,有的序列只有外显子,这正...

你去GFF里面看看 基因的注释信息核对一下; 有的基因只有一个外显子有可能的; 

回答于 2021-04-21 09:46

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sudo perl detect_collinearity_within_gene_families.pl -i /ho...

检查你提供的基因列表是否有问题,如果没问题你这个结果可能就是没有;

回答于 2021-04-21 09:45

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WGCNA如何只提取某一模块到Cytoscape中来绘制网络?

课程里面都有讲解的:https://bdtcd.xetslk.com/s/skOUW

回答于 2021-04-20 09:36

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为什么我用meme程序出来,作图时发现其中有一个没有motif呢,已...

没有就是在这个基因上没有找到motif。

回答于 2021-04-20 09:16

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老师,您好,恳请帮助,请问VPA方差分解分析中交叉部分为负值,...

可以贴下代码  和运行截图吗? 怀疑你的数据有问题吧

回答于 2021-04-19 09:47

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请问老师EvolView是不是不能用了?注册账号一直报错

刚刚试了可以用的:  你可以不注册账号试试

回答于 2021-04-19 09:46

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老师您好 ,我想问下我的虚拟机导入不成功是什么原因啊,WINDOW...

是不是ova文件下载不完整:https://www.omicsclass.com/question/1770 重新下载一下:

回答于 2021-04-16 17:30

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询问vcf文件生成SNP表时一些问题

做GWAS分析很多软件直接输入VCF文件就可以 比如TASSEL,为啥一定要生成VCF表格呢?  VCF文件看懂说明见:https://www.omicsclass.com/article/6  你需要用什么软件做GWAS你查看软件说明就好了,要求输入什么文件格式你自己准备一下; 你自己的数据编号有啥区别,我怎么会知道呢?  

回答于 2021-04-16 09:40