omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
14322金币数
81000 经验值
445个粉丝
主页被访问 86596 次

4093 个回答

0 赞同

怎么判断hmmer用不用二次搜索?二次搜索的意义是什么?

最好的办法你看看别人文献中是否进行二次搜索,如果是你也做二次搜索就是了; 一般保守的家族只做一次搜索就可以,一些进化快差异大的家族会做二次搜索;

回答于 2021-04-09 16:41

0 赞同

基因家族成员鉴定分析中,比如WORK基因:为什么要进行两次hmmer...

不了解WORK 基因家族, 最好的办法你看看别人文献中是否进行二次搜索,如果是你也做二次搜索就是了; 一般保守的家族只做一次搜索就可以,一些进化快差异大的家族会做二次搜索;

回答于 2021-04-09 16:22

0 赞同

老师,这个图正常吗,两个基因同一个motif

不正常, 可能软件任务这是同一个基因不同的转录本吧

回答于 2021-04-08 09:59

0 赞同

在获取染色体的长度信息的时候samtools faidx一直运行不出来,是...

基因组大,耐心等待, 或者虚拟机的内存多设置一些,内存太少也有可能运行不出来;

回答于 2021-04-08 09:57

0 赞同

已获得某一动物组织的转录本,想从中比对其他物种相同的基因,有...

你学习一下blast的使用:https://www.omicsclass.com/article/269

回答于 2021-04-07 12:50

0 赞同

输入脚本后报错,python mcscan jcvi 共线性分析报错:ValueError...

参考这个问题解决一下:https://www.omicsclass.com/article/572

回答于 2021-04-07 12:49

0 赞同

老师,请问为什么粘贴到这显示不全呢?

你用的是less打开的吗? 这里  :是搜索窗口; 我看是显示了,没问题的, linux基础不好应该学习:https://bdtcd.xetslk.com/s/17gwqZ 

回答于 2021-04-07 10:45

0 赞同

最后绘图的时候输入文件后报错,什么原因

看看你输入的文件里面这个基因的ID是不是在bed和simple文件里面都有

回答于 2021-04-07 10:09

0 赞同

老师,白菜的family.ctl这个文件如何获得,

照着课程例子自己制作;

回答于 2021-04-06 16:42

0 赞同

虚拟机打开显示休眠 不能打开新任务怎么办

这个原因很多,例如:https://www.omicsclass.com/question/1703 你可以在我们网站:www.omicsclass.com 搜索寻找解决办法

回答于 2021-04-06 10:08