omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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老师就是做到xpclr和TajimaD的时候出现下面的错误要怎么解决呀

检查你vcf文件里面第一列染色体ID是不是和你命令行里面的对应；再检查群体样本ID列表和VCF里面的是不是对应；

回答于 2025-01-05 16:34

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选其中一个样本的bam文件代表这个群体就行；

回答于 2025-01-05 16:32

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-g 这个参数是为分组填充颜色的，你这个每个样本一组，没有那么多颜色分配报错了；

回答于 2025-01-04 16:44

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你要理解每个过滤参数的意义，选择合适的参数过滤，每个项目不一样没有对错之分；你再仔细看看视频讲解吧；你觉得过滤太多了，就不设置这个参数过滤即可或者设置 --minGQ 0

回答于 2025-01-04 16:42

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这个一般默认参数即可；

回答于 2025-01-04 09:05

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--minGQ 80 这个参数去掉试试，这个参数过滤的比较狠；

回答于 2025-01-04 09:03

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数据有特殊没有拟合出曲线报错，你检查你的数据，是不是基因数量太少等情况；

回答于 2024-12-31 09:58

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你的powershell里面没有gzip这个命令

回答于 2024-12-29 09:05

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回答于 2024-12-29 09:04

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建议截图说明问题，我们的docker镜像里面已经安装了openssh的；要把数据放到容器里面，你需要把数据放着-v 设置的主机上的文件夹即可

回答于 2024-12-29 09:02