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泛基因集构建中JCVI做共线性分析构建完一半数据报错
core dumped 可能是电脑系统软件编译问题，导致运行不了，建议换个电脑试试的； 或者到我们云服务器上分析数据；
回答于 2025-03-31 17:28
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老师，别人发的一篇泛基因组文章，应该是从头组装构建的，每个基...
可行的，但是操作起来比较麻烦。建议自己从头构建吧 泛基因组构建有课程见：https://bdtcd.xetlk.com/s/lIqL9
回答于 2025-03-28 13:17
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采用你们课程的：Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r 以...
关于你提出的曼哈顿图上面的点显示不全的问题，你可以对脚本进行如下的修改 找到y轴设置 修改一下： 即把脚本中的y轴坐标轴上限增加5％ qqplot 也一样：
回答于 2025-03-14 18:50
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GWAS做关联区域分析时，根据p值获取关联区域中，为什么要用如下...
bedtools merge 加上P值是因为，上一步flank 取的是p值两边的region，如果不加pvalue.bed 会出现空档： https://bedtools.readthedocs.io/en/latest/content/tools/merge.html
回答于 2025-03-14 08:35