omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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动植物基因组组装课程，结构注释部分，运行braker.pl出错

刚刚测试了我们的镜像，没问题的，

回答于 2023-02-27 11:04

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输入文件有问题吧

回答于 2023-02-27 08:03

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可能你用的是苹果的M1或者M2芯片的电脑吧，这个我们的镜像可能不支持因为我们的镜像是基于x86架构的；

回答于 2023-02-25 08:40

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建议直接后台程序吧，用的终端不一样会有差异；在命令行最后加&符号即可；

回答于 2023-02-25 08:37

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高版本的hmmsearch 会报这个错误，建议删除这个参数--cut_tc hmmer 3.1b2 不会报错，

回答于 2023-02-22 13:27

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可以手动删除一些gap，重新构建进化树：https://www.omicsclass.com/article/221

回答于 2023-02-22 11:51

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差不多的，第一步读入数据可能不一样

回答于 2023-02-20 09:16

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这里的s$$$ 和s/// 相同的意思，sed 语法只要三个字符一样即可；例如 s###也是可以的；因为搜索替换的内容里面有/ #等，为了避免歧义用s$$$

回答于 2023-02-20 09:15

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用circos重新绘制这个图；mcscan X自带的绘图不好

回答于 2023-02-16 17:25

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要用我们组学大讲堂基因家族课程里面的paraAT才行，我们对ParaAt.pl脚本做了修改，如果自己下载的Para AT请查看官方帮助：https://github.com/wonaya/ParaAT 基因家族课程：https://zzw.xet.tech/s/bGBQV

回答于 2023-02-16 16:45