10 MCScanX 共线性区域太少

老师好,我的基因组组装注释完用busco评估完整性96.3%,然后进行共线性分析,染色体之内和之间共线性区域很少,请问是注释的有问题吗?该怎么检查呢?attachments-2023-05-SLHlZ7gC646766554d813.png

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

blast的 结果可以放宽一下e值;

mcscna X的参数也可以放宽一些试试的;

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  • Mr.Black 提出于 2023-05-19 20:07

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