omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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hifiasm结果偏大怎么办，是什么原因呢

你这个相差太大，是不是基因组survery 做的有问题；多倍体建议用GenomeScope 2.0 评估，GenomeScope 1.0可能评估错误在线评估网站：http://qb.cshl.edu/genomescope/genomescope2.0/

回答于 2023-08-09 09:10

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输入文件路径不对，gff3文件和基因组fasta文件，路径不对，你学习学习linux基础吧

回答于 2023-08-07 10:18

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命令行用错了吧，你再看看例子的

回答于 2023-08-05 08:21

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看看哪里是不是报错了：这个几个sed可以不用做：

回答于 2023-08-02 13:39

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# 我们修改后的安装方法，手动安装 $ git clone https://github.com/omicsclass/QTL-seq.git $ cd QTL-seq $ pip install -e .

回答于 2023-08-02 09:47

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说你的序列有问题你检查看看的

回答于 2023-08-01 17:00

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这里只有大片段复制的基因对，串联重复的基因对不在这里

回答于 2023-07-31 06:05

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电脑内存不够吧，你试试设置：https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2023-07-31 06:03

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两种方法都是可以的，不过大多数文章用GATK 得到vcf文件，后面过滤代码都可以用

回答于 2023-07-31 06:02

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看看这里：https://www.omicsclass.com/question/5943 建议使用我们的云服务器避免这个问题：https://study.omicsclass.com/index

回答于 2023-07-23 12:43