PASA Can't drop database

老师您好，我是在运行04.PASA_assemly中 Launch_PASA_pipeline.pl 这步的时候出现如下错误，

DBD::mysql::db do failed: Can't drop database 'Hcua_pasa'; database doesn't exist at /share/work/biosoft/PASApipeline/PASApipeline-v2.5.2/PerlLib/DB_connect.pm line 223

我的mysql安装完全是按照老师提供的脚本安装的，只是在启动 mysql 镜像时没有加 -v 参数（因为会 Exited），我看了下在下载mysql镜像前创建的log data conf三个目录都是空的，不知道除了老师说的这个解决办法外 https://www.omicsclass.com/question/4978 还能怎么解决

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分类：基因组学

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2023-08-28 15:54

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

看看这个，不行的话就不用mysql了，用sqlilte：

https://www.omicsclass.com/article/2019

PASA Can't drop database

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