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请问这里我有什么错误吗,怎么出来的不一样
GFF
GFF3
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基因家族分析
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1 个回答
omicsgene
- 生物信息
2023-08-22 16:20
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS
GFF 文件格式不标准,导致程序出错,你看看你的GFF文件
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李
提出于 2023-08-22 12:16
相似问题
老师您好,利用per脚本去除重复的转录本那一步我执行perl script/select_redundant_mRNA.pl mRNA2geneID.txt PTR2_domain_new_out_selected.txt PTR2_remove_redundant_IDlist.txt命令之后得到的文件中只有一行,和老师讲的格式完全不一样,如下图,我也截图了我的gff文件您看是因为它的原因吗?不知道该怎么解决了,请求老师指点一下
1 回答
对于已经公布基因组的物种,如何制备染色体水平的GFF3文件?因为平台上不公布。
1 回答
获取基因与mRNA的对应关系,注意文件中的位置mRNA的位置; #perl script/mRNAid_to_geneid.pl Arabidopsis_thaliana.TAIR10.41.gff3 mRNA2geneID.txt
1 回答
老师,我在做基因结构图的时候出现下面的问题,该如何解决
2 回答
基因家族分析:要是GFF文件中没有mRNA这一项的话,应该怎么处理加上这一行?我看有加gene这一行的,不知道怎么加mRNA这一项
1 回答
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