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获得结构域后进行clustalw比对没有结果

  • zhoy 2019-10-30 12:18
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你好老师有关网络图绘制的问题

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关于绘制OTU与环境因子互作的网络图

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老师您好，这两天在ensembl上下大豆整个的注释文件之后，打开发现转录本ID不是基因名而是KRH.....这种的名字，这样的话课上给的那些文本处理脚本很多用不了请问该咋办呀。

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十折交叉验证是啥意思

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mac上如何安装和使用mcscan做共线性分析？

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运行echo "dup_gene_paired.fa dup_gene_paired.aln dup_gene_paired.dnd\nX\n\n\nX\n" |clustalw时，速度太快，无法在Your choice:后面选择数字

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老师，请问您一下，我出现了不能改变工作路径的情况，找不到原因，麻烦老师帮忙

1 解决

如何用荧光定量数据绘制热图？

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如何将不同样品SNP整合及过滤？

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老师您好，我想请问一下用TBtools提取的gff文件做基因结构分析时某个基因显示有13个外显子，但是将这个基因序列提交到NCBI时却显示有12个外显子。请问这是什么情况啊

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各位老师，想问一下关于LAI评估基因组 组装质量的问题

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具有两个结构域的基因家族的分析

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GFF文件解释

  • 2019-10-25 11:06
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大麦基因家族分析时，进行基因结构分析时，hmmer提不到外显子gff文件是为什么？手动可以搜到

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有个问题想请教一下大家，从数据库中下载的原始数据的gff文件，他们是怎么得到这些基因的注释信息的的，测完序后根据序列比对吗？

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老师您好，我有个问题想请教您，就是以您看的文献来说，您觉得有转录因子调控CDPK激酶的文献，就是说转录因子可以和CDPK激酶的启动子结合的例子吗？因为我用某个CDPK酵母双杂交筛到了一个转录因子，现在不确定到底是这个转录因子结合了CDPK的启动子，还是这个CDPK激酶对这个转录因子磷酸化，对于它们的上下游关系我还不是太明白，是不是用CDPK筛到的转录因子就说明了什么关系呢它们之间

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请问如何根据已有转录组预测转录因子的靶基因？

  • 2019-10-23 18:21
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您好您看我挂机了为什么还是打不开这个TXT啊

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gzip: Phaseolus_vulgaris.PhaVulg1_0.45.gff3: Protocol error