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MCScanX中的layout 文件的y列

  • Iron 2020-05-21 15:19
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docker镜像

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5 老师，想请教一下，如果这两个地方都写了是不是重复设置了，写了一个另外一个就不需要了？

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提取基因在染色体位置时发现gff3文件中的染色体编号不好理解。疑惑。

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5 在Method menu进行相关性、相似性以及距离计算时，我想设定pearson,spearman系数>0.6的边构建网络 在Method menu进行相关性、相似请问老师设置参数的时。是在进行permutation时设置，还是在进行Bootstrap时设置。

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想请教一下，conet网络构建的课程，用提供的数据文件分析完全可以，但是用我的数据文件就报错。我尝试了用测序公司提供的xlsx格式，并把数据形式改成和课程提供数据完全一样，再转化成txt制表符文件格式后输入，选择第二个选项（由biom格式转化来的文件），结果报错。把测序公司提供的biom格式文件输入，选择第三个选项（biom HDF5格式，还是报错）。这是什么问题呢？

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TCGA的甲基化矩阵，是否需要使用normalizeBetweenArrays标准化处理？

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您好，老师我想知道基因组学、转录组学、代谢组学的优缺点？

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具体用那些数据分析 是两两比较还是总的比较

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进化关系分析老师你好！我想看看这几个bhlh基因中的哪个和sa6G516730的亲缘？ 进化分析得出sa6G516730跟bhlh12 关系比较近，但相似度分析sa6G516730跟bhlh114比较近这种情况下我该选择112还是114呢？

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老师您好我用咱们线下课程的代码做WGCNA，和样品数据相比，我自己的数据在第一步输出的结果都不一样。麻烦老师帮忙解答一下

  • 欢 2020-05-19 22:30
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用MCScanX分析没有得到tandem文件

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win10家庭版安装docker desktop,运行时报错

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在用tbtools做进化树+motif+结构图，出现这样的错误

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找不到kaks分析的文件

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老师！我想要以拟南芥中对应的同源基因对目标物种BHLH基因家族中的基因进行命名 遇到这种情况我该怎样选择目标序列呢？

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5 stringtie分析后没有基因名字

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老师，我是华为matebook13笔记本电脑，我可以打开电脑的bios，但是找不到设置虚拟化的开关

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用linux绘制circos图出现问题

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老师，您能讲一下qPCR相对定量里的数据计算吗？他里面的p值是什么？