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老师，在建立索引时整个基因组跑数据需要内存大，能不能把基因组分开不同的染色体，做完索引在合并？

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老师，如果租用服务器，内存得选多大的？

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老师，我做的物种是棉花，基因组约3.5G 利用组学大讲堂的方法建立索引失败，应该是内存不够，一般的电脑都是这样的，即使使用的小型服务器内存也达不到100G,这个问题应该怎么解决，这一步无法解决，后续无法分析，老师可否给一个可行性的意见！

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为什么用plantcare预测顺式作用元件时，很多基因连基本启动子元件都没有？？？不可能啊

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我用docker omicsclass/rnaseq 下载ncbi上转录组数据总是出现下面的问题

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5 hmmsearch新建HMM模型之后再次搜索出现报错，请问老师什么原因

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基因组分析能具体展示ka/ks的数值吗？？

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3 RNAseq转录组-基因差异表达分析

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问一下老师们，在用get_genefamily_bed.pl 这个脚本，提取自己基因家族位置信息的结果文件总是为空，下面是为的输入文件。perl get_genefamily_bed.pl -in1 SAT.IDlist.txt -in2 Oryza_sativa.IRGSP-1.0.47.gff3 -out MtN3_SAT.bed执行的是条命令。

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5 各位老师好，我买了你家的基因家族的课程，我咨询一下几个问题：（1）我分析NBS-LRR基因家族，其中CC结构域没有hmm文件，你们分享的文献中说用Paircoin2软件，我想问一下，这个软件怎么使用；（2）我用figtree美化进化树，为什么树枝上的Bootstrp是小数，而不是MEGA建树中的整数。

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3 共线性分析做组间时，anchors文件只有以下内容，进行后续筛选和绘图时，报错为“need more values to unpack"，请问是何种状况？mcscanx分析有物种和同源性要求吗？

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BSR-seq 结果中的曼哈顿图怎么看？

  • 2020-11-04 17:26
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老师，您好！bio-linux 挂载共享文件夹时报错No such device

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请问这个共线性分析报错如何解决？

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微生物多样性分析的程序复制shell中不能运行

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bio-linux 挂载共享文件夹时报错No such device

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5 进化树构建出问题

  • 2020-11-03 00:54
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5 请问老师基因家族分析这一步出现错误怎么解决，谢谢

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5 不好啥意思打扰了，我在服务器上用ClustalW对2000个基因进行比对，想看一下基因多态性，但是比对了很久，显示第5次跑数据了，是出了什么问题吗？比对完成后如何把非此基因的冗余序列去除，并进行可视化呢

  • NK-F 2020-11-02 10:58
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老师您好想想您请教一下这个wgcna中临床表型如何转换为数字性状数据呢，不知该如何定义