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GFF文件不能获取基因与mRNA的对应关系文件

  • 荣 2020-11-14 01:04
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请问构建进化树时出现三个分支是怎么回事呢

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10 请问有无预测蛋白质与蛋白质互作或蛋白质与DNA互作的网站？

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gff文件包含gene,cds,exon,mRNA的信息，但gene 和mRNA名称相同，不利于建立基因组索引，如何使用AWK命令批量只在mRNA的ID后面＋.1？

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dCAPS标记酶切之后在群体里面带型怎么都是一样的？

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求助mRNA ID 批量+1问题

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10 同一物种不同基因组（已经组装好）之间可以call snp么

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动物基因顺势作用元件的预测

  • 2020-11-11 16:47
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您在2019，9.27，提出的KEGG MApper 作图没有结果是什么原因呢，我也遇到了一样的问题

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老师，您好，按照教程，启动镜像后，要设置路径变量，按要求运行代码后，输入进入refdir的命令，显示没有这个文件夹，这是怎么回事？

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老师，在建立索引时，棉花整个基因组较大，对内存要求较高，棉花基因组由26染色体组成，可否单独对26条染色体建立索引，然后合并？

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5 如何从CAFE结果中提取扩张（或收缩）的基因家族

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老师，在建立索引时整个基因组跑数据需要内存大，能不能把基因组分开不同的染色体，做完索引在合并？

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老师，如果租用服务器，内存得选多大的？

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老师，我做的物种是棉花，基因组约3.5G 利用组学大讲堂的方法建立索引失败，应该是内存不够，一般的电脑都是这样的，即使使用的小型服务器内存也达不到100G,这个问题应该怎么解决，这一步无法解决，后续无法分析，老师可否给一个可行性的意见！

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为什么用plantcare预测顺式作用元件时，很多基因连基本启动子元件都没有？？？不可能啊

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我用docker omicsclass/rnaseq 下载ncbi上转录组数据总是出现下面的问题

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5 hmmsearch新建HMM模型之后再次搜索出现报错，请问老师什么原因

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基因组分析能具体展示ka/ks的数值吗？？

1 解决

3 RNAseq转录组-基因差异表达分析