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3 建立进化树

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MCscan

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转录组数据怎么样用来写文章

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GEO下载到的数据，只有 fpkm，可以用limma包进行差异分析么，试了一下连续两个数据集的所有FDR都是1，用t检验也是一样，不知道哪里出问题了

  • 。 2021-12-18 20:10
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老师，我在做进化树的时候，Newick文件导不出咋解决

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老师，我的这两个文件里，图片上有5对共线性基因，而pairs里边有4对，这是怎么回事啊

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老师，我共线性出的图没红线，这是怎么回事啊

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5 老师，我在利用circos绘图运行出现这种情况，该怎么处理啊？

  • 2021-12-16 09:06
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老师，我在共线性那步加sudo java ,但是又出现错误，这是怎么回事啊？

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基因家族成员鉴定

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3 建立进化树

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基因家族建树

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老师您好，利用per脚本去除重复的转录本那一步我执行perl script/select_redundant_mRNA.pl mRNA2geneID.txt PTR2_domain_new_out_selected.txt PTR2_remove_redundant_IDlist.txt命令之后得到的文件中只有一行，和老师讲的格式完全不一样，如下图，我也截图了我的gff文件您看是因为它的原因吗？不知道该怎么解决了，请求老师指点一下

  • Jc 2021-12-14 21:08
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circos作图

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blast2go报错，升级blast ncbi-blast-2.3.0+ 到 ncbi-blast-2.6.0+ 报错

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热图报错

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老师您好，不同样本使用的引物不同，课程提供的脚本在去噪这一步以及后续物种注释都只有一个引物。如何对不同引物进行统一的物种注释和多样性分析？

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老师。我在做mcscan时说是打不开这个java，这是怎么回事啊

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老师，我在做这一步是老是显示404not found,这是怎么回事啊

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Win10家庭版装Docker桌面版出现问题