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老师您好，我这边在处理扩增子数据分析时，进行OTU分析时不论用哪种方法都会报错“ERROR RAISED DURING STEP:Assign taxonomy” segmentation fault，用您那边提供的样本数据也是有这个报错，请问怎么解决呀！

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5 扩增子测序分析，qiime1的assign_taxonomy.py命令中，如果用blast方法比对序列，可否修改比对的相似度阈值（比如identity或者similarity）？

  • bugz 2021-12-22 19:03
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你好，请问一下，我返回来的数据是公司将双端测序的结果进行拼接、指控后得到的，每个样本只有一条.fq文件，这种如何导入啊？

2 解决

第一步文件导入qiime2一直出错，按照视频设置好

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老师好 我在用qiime2进行机器学习时，报错Error: QIIME 2 has no plugin/command named 'rescript'，我应该怎么安装这个插件呢？

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扩增子OTU分析报错

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我想问一下公司的cleandata怎么导入到qiime2里面去，原始数据我会 建一个rawData_manifest，但是cleandata只有一个fastq文件了。

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qiime2 python "matplotlib" _tkinter.TclError: couldn't connect to display "localhost:12.0" 报错

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基因家族扩张收缩分析中，如何才算是显著扩张和显著收缩呢？

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16v34区测序碱基数

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老师，我用的就是课程里的代码，分配了6个g，还是报错了，麻烦老师看看是哪里不合适Segmentation fault uclust

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关于细菌illumina测序数据demultiplex的问题

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关于q2-cutadapt demux 的问题

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老师您好，请求帮助！MENA分子生态网络分析时，上传200个OTU节点，但是最后显示nodes为383 （其中一部分不包括上传的节点），请问这样的结果合理吗？为什么会出现这样的情况呢

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老师，您好，我用cytoscape conet绘制微生物网络图，用原始biom文件还是txt文件均报错，报错内容为java.lang.NumberFormatException: You did not specify the row and column number of the matrix correctly! 请问是什么原因，

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老师，您好，恳请帮助，请问VPA方差分解分析中交叉部分为负值，并且可解释部分＋不可解释部分不为1，这个怎么解释呢

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你好，我是初次接触网络分析绘图，在R中运行以下代码总是报错

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10 老师，您好，我想请问一下，conet分析时，如果不加环境因子的时候可以正常运行，但是加上环境因子就不行，想问一下是什么原因？下面是我环境因子的格式，我用notepad++转换成文本格式了

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16S分析批量拼接时报错如何解决

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请问扩增子分析的时候保留多少条OTU/ASV比较合适？

  • 大k 2021-02-28 23:05