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老师我在解压eggnog.db.gz文件时显示失败

  • Oho 2025-03-08 09:57
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宏基因组基因定量salmon

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想请教一下 cds.TEM 数据 ，然后也得到了cds里的名和KO0001表对应好的eggNOG里的表。想变成 KO0001-样本 的丰度数据表，应该怎么操作，合并KO0001的丰度？

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请问这个是中间文件吗，注释成功后，就可以删除掉，节约空间，是吗？

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组装后的cds.fa文件进行Kegg注释

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请问可以同时运行2个terminal吗，在内存和存储还有cpu都有剩余很多的情况下

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请问这2个sam文件对后续有什么帮助吗 占用内存太大 想删掉 不知道有没有用

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想咨询一下，我有1批宏基因组数据，可不可以样本对半，分成2次进行

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CAZy注释阶段，hmmer的太慢占用cpu只有一直很少

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想咨询一下各位老师，宏基因组注释的时候，我有总共160G的土壤宏基因组数据(21个样本)

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请问我想注释出碳氮磷硫功能基因及丰度，有什么教程吗

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宏基因组分析，用来分组的metadata格式具体是什么？

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binning 想做功能注释，但还是不知道该用哪些文件进行基因预测和功能注释？

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binning物种注释的时候，gtdbtk软件和数据包已经更新，旧版的匹配不上，请问应该怎么更新一下软件，谢谢

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想咨询一下，可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程？

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想咨询一下，可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程？

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想咨询一下，宏基因组功能注释的视频中，有一步是用cds.fa文件注释物种，想咨询一下，这个物种注释出来后，应该如何计算丰度？是根据前面cds.count来计算吗，这样计算出的物种丰度可靠吗？因为有些物种可能基因很多。

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请问，我弄了一个256线程，1t内存的服务器，想处理500G的宏基因组注释，大概需要跑多少天，全套下来

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binning功能注释

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请问功能注释里面，想注释KEGG