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物种注释 16S 出现killed

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请问功能注释里面，想注释KEGG

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本地镜像进去一次之后就报这个错误

  • JACK 2024-09-20 18:21
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binning功能注释

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koeken报错

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3 #16S 分析 deblur的方法应用时报错，如下图，前面的数据是严格按照视频进行的，请老师解答

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向管理员要了metagenomics：v1.0的本地镜像，但是输入 docker load -i metagenomics-v1.0.tar.gz后一直报错 open /var/lib/docker/tmp/docker-import-2588968250/metagenomics/json: no such file or directory

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deblur生成featrue-table出现错误

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想请教一下，我是基于windows+docker做的宏基因组注释，然后在去宿主这一步，卡住了 不知道为啥 一直不动

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5 ###16S/18S 方法1：dada2 数据质量过滤，合并，去嵌合，去引物一步完成。这个步骤代码报错，请老师帮我看一下这个问题，之前有帖子也有这个问题，说是建议下载咱们课程提供的docker镜像，我就是下载的咱们课程的docker镜像，但还是出现了这个问题，请老师解答，谢谢！

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不知道为什么，产生不了unmap文件

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我按照视频里的方法用deblur的方法进行分析，输入了51个样本，但是最后就剩下了35个样本，如图所示，请问是那一步出现错误了，是 数据有问题还是写的参数有问题

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已经windows系统里下载了docker 也打开了，但还是运行不了. doc.sh

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物种注释出现killed,我调了参数还是出现这个问题，除了用台式机或者服务器之外还有别的办法吗？

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请问，我弄了一个256线程，1t内存的服务器，想处理500G的宏基因组注释，大概需要跑多少天，全套下来

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16s分析，数据导入过程中出现了问题，请问怎样解决？

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想咨询一下，宏基因组功能注释的视频中，有一步是用cds.fa文件注释物种，想咨询一下，这个物种注释出来后，应该如何计算丰度？是根据前面cds.count来计算吗，这样计算出的物种丰度可靠吗？因为有些物种可能基因很多。

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想知道出现A2这种情况是因为数据的原因吗

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想咨询一下，可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程？

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宏基因组单独组装后的contigs需要注明来源以构建基因丰度表，混合组装呢