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10 snpEFF生成的txt文件每一列数值的含义

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5 如果物种基因组较小，所鉴定的基因家族基因很少，只有几个，这种情况怎么处理才能顺利的发文章？

  • 2019-06-21 14:00
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5 Mac系统的共享文件后为什么不能hmmsearch（是共享文件的原因吗）,相同的操作在win上没问题？

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5 生成MCScanX的gff文件时发现蛋白序列id是cds序列的id，请问怎么转成mRNA或者geneID

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老师你好，我想问一下，我想用其他物种的一条蛋白质序列搜索小麦基因库有没有相似的基因，在Linux中怎么比对？谢谢

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5 mafft可以批量多序列比对吗

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BSA实验到底怎么取样比较好？

  • 2019-04-29 14:01
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10 多序列比对使用texshade包输出图片的问题

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模式植物如拟南芥、水稻还能发基因家族文章吗？

  • 2019-04-18 19:54
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已有一段序列及相应的氨基酸如何blast基因组中的基因家族

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5 老师，我利用脚本得到对应基因的蛋白序列： perl script/get_fa_by_id.pl WRKY_removed_redundant_IDlist.txt Arabidopsis_thaliana.TAIR10.pe p.all.fa WRKY_pep_need_to_confirm.fa 时，程序出现错误。 ，这是怎么回事啊？

  • DII 2019-04-11 19:38
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老师，请问一下青蒿的基因组数组可以在那个网站上下载得到呢？

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5 下载拟南芥基因组注释文件老是报错

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老师我想问一下我没有以下这种情况，就是比如说鉴定的马铃薯基因在马铃薯数据库中有，但是在ncbi中没有找到它的序列，这种情况应该怎么做呢，因为要做基因定量的话只有在ncbi中可以看到它的CDS区

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请教一下，如果基因组注释文件不是染色体序号而是scaffold序号，是不是代表着这个物种的基因组染色体定位尚不明确呀？

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请问老师，做基因组共线性的物种组装必须都是complete genome吗？还是 scaffold也可以呢? scaffold水平有什么弊端？

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5 MCScanX分析中collinearity文件没有结果 其余都有 是什么原因呢

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进化树构建

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5 基因家族今年还好发文章吗？

  • 2019-03-15 16:52
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5 现在做基因组denovo还能发个啥水平的文章？

  • 2019-03-15 16:50