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kaks计算

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基因组测序品种选择问题

  • 2021-09-17 10:59
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老师你好，问一下如果所做物种只有基因组数据，没有转录本，CDS等文件，该用什么软件分析得到别的数据

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基因家族扩张收缩分析中，怎么样才算是显著扩张和显著收缩？

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在绘制共线性图是出现“zerodivisionerror: float division by zero”错误。我按照老师的讲解一共准备了五个物种的共线性资料，最后在绘图时报错。

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10 在基因组组装中，有很多scaffold没有组装到基因组上，是因为什么？

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老师好！我使用JCVI按照官网流程处理两个物种，每次都提示ValueError: A total of 0 anchor was found. Aborted.麻烦您帮我看看，谢谢！

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老师，在做基因结构时，脚本只能从GFF文件提出mRNA和CDS，做不出基因结构图，该如何解决，图中分别时GFF文件，脚本和提取的结果

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20 请问一下老师，物种间的进化树该怎么做？需要准备什么文件、工具？

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求助cafe预测基因家族总是在最后一步报错!

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老师，我在做基因序列结构分析的时候，有的序列只有外显子，这正常吗

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运行时报错

  • 2021-04-20 19:36
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老师，白菜的family.ctl这个文件如何获得，

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老师，我在做共线行分析时，出现这种情况，该如何解决

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请问scaffold序号和染色体序号有什么关系？分析得到基因定位在scaffold上怎么解释？谢谢老师

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请问如何知道用MEME预测的motif代表的具体结构是什么（譬如说C2结构盒以及这个结构的功能）

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老师您好，请问使用Docker时需要把测定数据定位到基因组上吗？

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请问要提取每一条fasta序列>这个符号之后的第一行内容 该怎么在虚拟机下设代码呢

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怎么确定突变速率r呢？

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基因家族分析