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您好!请问contig上的基因怎么进行染色体定位呀

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老师您好！我把顺势作用元件的名称都改成了大写的，但是出现了如下报错Request-URI Too Long The requested URL's length exceeds the capacity limit for this server.

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睡神15分钟前 你解决了吗？我也遇到了这种情况，单个基因能显示顺式作用元件，我再一个一个加上去，最多两个显示作用元件，剩下的 都是CDS了，GeneID 特殊符号 格式什么的都试过了，还是不行

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怎么辨别鉴定的家族成员中是否有假基因？

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请问如何用命令把基因组里blast得到的scaffold批量提取出来？

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得知一个基因组序列，怎样做染色体定位？

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5 转录调控子（transcriptional regulator）和转录因子（transcriptional factor）什么区别？

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请问老师MYB基因分1R，2R和3R怎么分的？

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求助LTR harvest 软件的安装教程

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我下载的unmasked基因组和对应的GFF，GFF文件比基因组大的多，而且用TBtools提取的基因组序列，结果生成一个FA文件和一个FAI文件，提取的序列文件是空的。我想请教一下，这种情况应该怎么解决？

  • 2020-06-12 17:23
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linux（虚拟机） 安装Aspera的方法？

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老师你好，我是在NCBI上面下载的枣的gff，以及蛋白质序列，做共线性分析的时候，perl get_gene_position.pl GCF_000826755.1_ZizJuj_1.1_genomic.gff AT.gff输出之后的文件与perl get_fa_by_id.pl AT1.gff GCF_000826755.1_ZizJuj_1.1_protein.faa pep.fa输出的文件是空的，应该怎么办。

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老师您好，我在做物种间基因组共线性分析时没有得到.anchors文件并且出现list index out of range报错,请问一下是什么原因？

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我想请教一个问题，如果没有GFF文件，能从基因组中进行基因序列提取吗？批量的那种？ 另外，方便的话可否推荐一个提取序列好用的软件，感谢！

  • 2020-05-28 21:29
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老师，您好！对于NCBI上没有公布基因组注释文件的，我该怎么去找对应物种的gff？

  • 2020-05-27 21:47
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有没有TBtools的安装包啊，免不免费的都行

  • sham 2020-05-27 15:46
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5 如何对比判断一个物种两个基因组质量的好坏？

  • 2020-05-26 18:14
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5 构建系统进化树时利用课程提供的脚本提取不出来cds序列是为何？

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5 老师，您好，学习咱们得基因家族分析课程。按照咱们得代码运行，发现第二次搜索hmmsearch，发现输出空吧，我把以前生成的文件和你们提供的demo比了一下都一样，可是WRKY_domain_new_out.txt空白

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进化关系分析老师你好！我想看看这几个bhlh基因中的哪个和sa6G516730的亲缘？ 进化分析得出sa6G516730跟bhlh12 关系比较近，但相似度分析sa6G516730跟bhlh114比较近这种情况下我该选择112还是114呢？