1 回答

运行完Cellranger之后，没看见pbmc-stim里面有out文件夹，然后我再次运行的时候，报错了

1 回答

请问我在做性状绘图时出现报错，我的数据格式应如何修改

  • Max 2025-09-15 11:23
1 回答

请问我在做GWAS性状绘图时出现以下报错，我的数据格式该怎样修改，该如何解决？

  • Max 2025-09-15 11:20
2 回答

dadi

1 回答

泛基因组运行cat ../id.txt|while read ind;do agat_sp_keep_longest_isoform.pl --gff ./${ind}.gff3 -o ./${ind}.longest_isoform.gff3命令时提醒以下情况，请问具体该怎么解决

1 回答

泛基因组分析教程中的env.sh文件运行自己相应物种时，里面的命令行是不是要进行修改如下图所示

0 回答

组学大讲堂的一个T2T组装培训课，在进行组装前先除去了和细胞器DNA高度相关的reads。但是我看现在大部分的文章没有特别处理细胞器的DNA，是在组装的过程中已经被除掉了吗？

0 回答

请问现在T2T的组装，还需要先除掉和细胞器DNA相关的reads再进行组装吗？组学大讲堂的课里面除掉了相关的reads。但是我看现在的论文，似乎都没有对细胞器的DNA进行单独的处理。

2 回答

老师，我执行这一步时，总是说找不到文件，但是我检查了都正常呀，都能正常打开

1 回答

存在缺失分析

0 回答

PGGB泛基因组报错

1 回答

dadi分析

1 回答

5 mummer比对syri进行SV检测报错

3 回答

docker 安装

1 回答

基因组过大，能不能分割基因组做重复序列注释

  • 2025-09-10 13:29
1 回答

请问一下老师，在大讲堂学习的时候用的是docker＋Linux系统，但是回来以后课题组用的是vmware虚拟机，那我怎么将docker的镜像放到vmware中呢

  • Nier 2025-09-10 12:17
2 回答

老师，拟时序基础初步分析时，运行以下代码时Rscript $scripts/cell_trajectory_monocle3.r --rds ../04.cell_type_ann_leaf/leaf.added.celltype.qs \ --use.seurat.umap --groupby mycelltype -o monocle3.1 --cpu 6，出现图中报错，是因为聚类分群的时候resolution值太低了吗

0 回答

在全基因组选择育种课程中，所有需要预测的样本（在 pred_ID.csv 中列出的ID），必须已经存在于那个巨大的基因型文件 imputed_snp.raw 中，是否就意味着我只能预测现有群体的缺失部分？我需要预测新的群体，那这 pred_ID.csv文件该如何编写？

1 回答

tgsgapcloser 如何控制minimap占用的内存

1 回答

老师，我要分析几个品种的基因表达量数据，在公共数据库大部分只有叶片组织的播种24天及以后的数据，我都选取播种24天的数据进行转录组分析可以么，另外我想以其中一个品种作为参考基因组，我是不是需要把这个基因组的fasta文件和gff文件建立索引，然后再分析这几个基因组的rnaseq数据，包括参考基因组的ranseq